TEMÁTICA DE ESTUDIO
The Group’s research areas are organized as follows:
1. Inflammatory Bowel Disease (IBD):
1.1. Understanding the mechanisms underlying IBD, based on systems biology and supported by omics technologies:
– Identification of new therapeutic targets in IBD.
– Identification of proteins (serum, extracellular serum vesicles, and urine) with potential as biomarkers in IBD.
– Determination of immunoregulatory molecules as predictors of IBD severity and prognosis.
– Characterization of biomarkers using proteomics at the time of diagnosis (PI16/01296, FI17/00143, PI19/01034).
– Analysis of the metabolome in serum and urine (PI16/01296, FI17/00143, PI19/01034).
– Metagenomic analysis of fecal microbiota (PI19/01034, CD19/00247).
– Analysis of the effect of immunomodulatory peptides secreted by the gut microbiota on mucosal dendritic cells in IBD.
– Transcriptomics of intestinal biopsies as biomarkers.
1.2. Epidemiology of IBD:
– Assessment of the incidence of IBD in Spain (PI16/01296, FI17/00143).
– International collaborative efforts to describe the epidemiology of IBD and the costs associated with its treatment.
1.3. Real-world evidence studies to generate knowledge on the efficacy, safety, and use of therapeutic agents in IBD:
– International and national leadership in real-world evidence studies.
– International collaborations in real-world evidence studies.
1.4. Strategies for patient selection and treatment optimization in patients with IBD:
– Switching to biosimilar medications.
– Identification of biomarkers of response to treatment with biologics and tofacitinib in IBD using a multi-omic and cytometric approach (PI18/00622, CIBEREHD intramural project, PI24/00159).
– Comparative study of the immunomodulatory effect of combination biologic therapy in inflammatory bowel disease (COMBINE) (PI22/01069, CD23/00075, FI23/00071).
1.5. Strategies for the advanced therapy cycle in IBD:
– Withdrawal of anti-TNF drugs in patients with IBD (PI15/00560, PI24/00141).
– Identification of biomarkers predictive of relapse following withdrawal of anti-TNF treatment in patients with IBD.
– Coordination of international initiatives on the treatment cycle.
1.6. Safety of IBD treatments:
– Safety during pregnancy and breastfeeding (coordination of the national DUMBO registry (ICI19/0083).
– Risk of thromboembolic events in patients treated with JAK inhibitors (PI21/01086).
2. Helicobacter pylori infection:
– Science of clinical practice implementation and evaluation: evidence-based recommendations on actual routine practice.
– International coordination of the European Registry on Helicobacter pylori Treatment, a prospective study of clinical practice involving almost 100,000 patients from 300 hospitals in 40 European countries.
– International coordination of the Global Registry on Helicobacter pylori Treatment, which includes hundreds of hospitals across five continents.
– Primary care: surveys of healthcare professionals, evaluation of clinical registries, and development of outreach programs.
– Prevalence, transmission, resistance, and socio-health factors of the infection.
Seguridad de los tratamientos para la enfermedad inflamatoria intestinal durante el embarazo y la lactancia: Impacto en las madres y en los niños (Registro Dumbo). ICI19/00083. ISCIII. 2020-2022.
El objetivo del proyecto es evaluar la seguridad (principalmente el riesgo de infecciones graves) de los tratamientos para la enfermedad inflamatoria intestinal (EII) en el embarazo y en los niños expuestos durante la gestación, desde el nacimiento hasta los 4 años de edad; conocer el riesgo de acontecimientos adversos graves durante el embarazo y el parto y en la descendencia, asociados al tratamiento con fármacos para la EII.
Esta ayuda está financiada por el Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020 y el ISCIII – Subdirección General de Evaluación y Fomento de la Investigación – y cofinanciadas por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional, Programa Operativo Plurirregional de España 2014-2020 (Objetivo temático “Potenciar la investigación, el desarrollo tecnológico y la innovación”; Objetivo Específico “Fomento y generación de conocimiento de frontera y de conocimiento orientado a los retos de la sociedad, desarrollo de tecnologías emergentes”; Actuación “Proyectos de investigación orientados al Reto de Salud, Cambio Demográfico y Bienestar”, y se regirán de acuerdo con el Reglamento (UE) Nº 1303/2013 y de acuerdo al Reglamento (UE) Nº 1301/2013 del Parlamento Europeo y del Consejo, de 17 de diciembre de 2013 sobre Fondo Europeo de Desarrollo Regional.

Comprehensive study of mechanisms underlying inflammatory bowel disease: a multi-omic approach of a newly diagnosed cohort. PI19/01034. ISCIII. 2020-2022.
El objetivo del proyecto es profundizar en la comprensión de los mecanismos que subyacen la enfermedad inflamatoria intestinal (EII) mediante un abordaje complejo, basado en la biología de sistemas y apoyado en las tecnologías ómicas. Este estudio se realizará en una corte de pacientes recién diagnosticados de EII, cuando los tratamientos aún no han modificado la biología de los pacientes. En concreto, se validarán proteínas con potencial como biomarcadores, seleccionadas en una fase previa del estudio; se caracterizarán mediante proteómica, la mucosa colónica de estos pacientes en el momento del diagnóstico y se analizará el metaboloma en orina (como reflejo del estado del paciente y de su interacción con la microbiota intestinal). Esta misma caracterización se hará en controles sanos, y toda la información se integrará para inferir relaciones ocultas entre moléculas que, de otro modo, no serían evidentes, con el objetivo de desentrañar el “integroma” de la EII.
Esta ayuda está financiada por el Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020 y el ISCIII – Subdirección General de Evaluación y Fomento de la Investigación – y cofinanciadas por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional, Programa Operativo Plurirregional de España 2014-2020 (Objetivo temático “Potenciar la investigación, el desarrollo tecnológico y la innovación”; Objetivo Específico “Fomento y generación de conocimiento de frontera y de conocimiento orientado a los retos de la sociedad, desarrollo de tecnologías emergentes”; Actuación “Proyectos de investigación orientados al Reto de Salud, Cambio Demográfico y Bienestar”, y se regirán de acuerdo con el Reglamento (UE) Nº 1303/2013 y de acuerdo al Reglamento (UE) Nº 1301/2013 del Parlamento Europeo y del Consejo, de 17 de diciembre de 2013 sobre Fondo Europeo de Desarrollo Regional.

Efecto de los péptidos inmunomoduladores secretados por la microbiota intestinal sobre las células dendríticas de la mucosa en los pacientes con Colitis Ulcerosa. GETECCU-MSD. 2017-2018.
Proteomic characterization of extracellular vesicles in inflammatory bowel diseases: a novel proteomic approach for biomarker discovery. GETECCU-Faes Farma. 2017-2018.
Estudio prospectivo y multicéntrico sobre la epidemiología y características “ómicas” de la enfermedad inflamatoria intestinal de reciente diagnóstico en España. PI16/01296. ISCIII. 2017-2019.
Evaluar la incidencia de la enfermedad inflamatoria intestinal.
Esta ayuda está financiada por el Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013-2016 y el ISCIII – Subdirección General de Evaluación y Fomento de la Investigación – y cofinanciadas por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional, Programa Operativo Crecimiento Inteligente 2014-2020 de acuerdo al Reglamento (UE) Nº 1303/2013.

Immunoregulatory molecules as biomarkers predicting response to biological therapies and disease severity in immune-mediated inflamatory disorders. BIOMID PROJECT. PIE13/00041. Proyecto coordinado. ISCIII. 2014-2016.

Cátedra de patrocinio de docencia e investigación en enfermedad inflamatoria intestinal ABBVIE – UAM. Departamento de Medicina de la Universidad Autónoma de Madrid. 2014-2016.
OPTICARE: Optimal h. Pylori management in primary care. United European Gastroenterology. 2013-2015.
Predicción de respuesta a corto y largo plazo al tratamiento con fármacos anti-TNF en pacientes con enfermedad de Crohn. Estudio PREDICROHN. ISCIII. PI12/02557. 2013-2015.
Compartimentalización de las células dendríticas intestinales humanas en enfermedad de Crohn. SAF2014-56642-JIN. MINECO. 2015-2017.
Suspensión del tratamiento anti-TNF en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal: ensayo clínico multicéntrico, prospectivo y aleatorizado. PI15/00560. ISCIII. 2016-2018.
Los exosomas séricos en la enfermedad de Crohn: caracterización molecular y significado clínico. Beca Gonzalo Miño de la Fundación Española de Gastroenterología. 2015-2017.
Esofagitis eosinofílica: estudios en biopsia esofágica y sangre periférica para la identificación de biomarcadores de la enfermedad y de la respuesta al tratamiento. PI17/00008. ISCIII. 2018-2020.
Analizar los cambios en la expresión génica y de proteínas en biopsias esofágicas de pacientes adultos con esofagitis eosinofílica.
Esta ayuda está financiada por el Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2013-2016 y el ISCIII – Subdirección General de Evaluación y Fomento de la Investigación – y cofinanciadas por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional, Programa Operativo Crecimiento Inteligente 2014-2020 de acuerdo al Reglamento (UE) Nº 1303/2013.

Proteomic characterization of extracellular vesicles in inflammatory bowel diseases: a novel proteomic approach for biomarker discovery. European Chron’s and Colitis Organisation. 2018.
Identificación de biomarcadores de respuesta al tratamiento con fármacos biológicos en la enfermedad inflamatoria intestinal mediante abordaje proteómico y de citometría de masas. PI18/00622. ISCIII. 2019-2021.
Uso de técnicas másivas de citometría de masas y proteómica para la identificación de biomarcadores para el mejor tratamiento de la enfermedad inflamatoria intestinal (EII).
Esta ayuda está financiada por el Plan Estatal de Investigación Científica y Técnica y de Innovación 2017-2020 y el ISCIII – Subdirección General de Evaluación y Fomento de la Investigación – y cofinanciadas por el Fondo Europeo de Desarrollo Regional, Programa Operativo Crecimiento Inteligente 2014-2020 de acuerdo al Reglamento (UE) Nº 1303/2013.

Chaparro M, Gordillo J, Domènech E, Esteve M, Barreiro-de Acosta M, Villoria A, Iglesias-Flores E, Blasi M, Naves JE, Benítez O, Nieto L, Calvet X, García-Sánchez V, Villagrasa JR, Marin AC, Donday MG, Abad-Santos F, Gisbert JP. Fendrix vs Engerix-B for Primo-Vaccination Against Hepatitis B Infection in Patients With Inflammatory Bowel Disease: A Randomized Clinical Trial. Am J Gastroenterol. 2020 Nov;115(11):1802-1811. doi: 10.14309/ajg.0000000000000926. PMID: 33156099.
Nyssen OP, Bordin D, Tepes B, Pérez-Aisa Á, Vaira D, Caldas M, Bujanda L, Castro-Fernandez M, Lerang F, Leja M, Rodrigo L, Rokkas T, Kupcinskas L, Pérez-Lasala J, Jonaitis L, Shvets O, Gasbarrini A, Simsek H, Axon ATR, Buzás G, Machado JC, Niv Y, Boyanova L, Goldis A, Lamy V, Tonkic A, Przytulski K, Beglinger C, Venerito M, Bytzer P, Capelle L, Milosavljević T, Milivojevic V, Veijola L, Molina-Infante J, Vologzhanina L, Fadeenko G, Ariño I, Fiorini G, Garre A, Garrido J, F Pérez C, Puig I, Heluwaert F, Megraud F, O’Morain C, Gisbert JP; Hp-EuReg Investigators. European Registry on Helicobacter pylori management (Hp-EuReg): patterns and trends in first-line empirical eradication prescription and outcomes of 5 years and 21 533 patients. Gut. 2021 Jan;70(1):40-54. doi: 10.1136/gutjnl-2020-321372. Epub 2020 Sep 21. PMID: 32958544.
Chaparro M, Garre A, Iborra M, Sierra M, Barreiro-de Acosta M, Fernández-Clotet A, de Castro L, Boscá-Watts M, Casanova MJ, López-García A, Lorente R,
Rodríguez C, Carbajo AY, Arroyo MT, Gutiérrez A, Hinojosa J, Martínez-Pérez T, Villoria A, Bermejo F, Busquets D, Camps B, Cañete F, Manceñido N, Monfort D, Navarro-Llavat M, Pérez-Calle JL, Ramos L, Rivero M, Angueira T, Camo P, Carpio D, García-de-la-Filia I, González-Muñoza C, Hernández L, Huguet JM, Morales VJ, Sicilia B, Vega P, Vera I, Zabana Y, Nos P, Suárez Álvarez P, Calviño-Suarez C, Ricart E, Hernández V, Mínguez M, Márquez L, Hervías Cruz D, Rubio Iturria S, Barrio J, Gargayo-Puyuelo C, Francés R, Hinojosa E, Del Moral M, Calvet X, Algaba A, Aldeguer X, Guardiola J, Mañosa M, Pajares R, Piqueras M, García-Bosch O, Lopez Serrano P, Castro B, Lucendo AJ, Montoro M, Castro Ortiz E, Mesonero F, García-Planella E, Fuentes DA, Bort I, Delgado-Guillena P, Arias L, Iglesias A, Calvo M, Esteve M, Domènech E, Gisbert JP. Effectiveness and safety of ustekinumab in ulcerative colitis: Real-world evidence from the ENEIDA registry. J Crohns Colitis. 2021 Apr 16:jjab070. doi: 10.1093/ecco-jcc/jjab070. Epub ahead of print. PMID: 33860795; PMCID: PMC8083263.
Chaparro M, Garre A, Mesonero F, Rodríguez C, Barreiro-de Acosta M, Martínez-Cadilla J, Arroyo MT, Manceñido N, Sierra-Ausín M, Vera-Mendoza I, Casanova MJ, Nos P, González-Muñoza C, Martínez T, Boscá-Watts M, Calafat M, Busquets D, Girona E, Llaó J, Martín-Arranz MD, Piqueras M, Ramos L, Surís G, Bermejo F, Carbajo AY, Casas-Deza D, Fernández-Clotet A, García MJ, Ginard D, Gutiérrez-Casbas A, Hernández L, Lucendo AJ, Márquez L, Merino-Ochoa O, Rancel FJ, Taxonera C, López Sanromán A, Rubio S, Domènech E, Gisbert JP. Tofacitinib in Ulcerative Colitis: Real-world Evidence From the ENEIDA Registry. J Crohns Colitis. 2021 Jan 13;15(1):35-42. doi: 10.1093/ecco-jcc/jjaa145. PMID: 32969471.
Casanova MJ, Chaparro M, Nantes Ó, Benítez JM, Rojas-Feria M, Castro-Poceiro J, Huguet JM, Martín-Cardona A, Aicart-Ramos M, Tosca J, Martín-Rodríguez MDM, González-Muñoza C, Mañosa M, Leo-Carnerero E, Lamuela-Calvo LJ, Pérez-Martínez I, Bujanda L, Hinojosa J, Pajares R, Argüelles-Arias F, Pérez-Calle JL, Rodríguez-González GE, Guardiola J, Barreiro-de Acosta M, Gisbert JP; EVODIS Study Group*. Clinical outcome after anti-tumour necrosis factor therapy
discontinuation in 1000 patients with inflammatory bowel disease: the EVODIS long-term study. Aliment Pharmacol Ther. 2021 May 7. doi: 10.1111/apt.16361.
Epub ahead of print. PMID: 33962482.